流行性乙型脑炎需要做的检查主要包括病毒分离、血气分析、血象检查、特异性IgM抗体检测等。

1、病毒分离：乙脑病毒主要存在于脑组织中，疾病的初期取血液及脑脊液分离病毒，其阳性率很低，在病初早期死亡者的脑组织中可分离出乙脑病毒。一般临床部开展。

2、血气分析：对重症患者可作血气分析，以便及早发现呼吸功能衰竭及酸碱代谢平衡紊乱等病理生理变化，近年来，国内对部分乙脑呼吸衰竭患者进行测定，发现多以呼吸性酸中毒为主，其次为呼吸性碱中毒。

3、血象检查：血象白细胞总数增高，一般在10～20×109/l左右，个别可达40×109/l，这与大多数病毒感染不同。白细胞分类中可见中性粒细胞高达80%以上，并有核左移，2～5天后淋巴细胞可占优势，部分患者血象始终正常。

4、特异性IgM抗体检测：常用间接免疫荧光法、酶联免疫吸附试验法检测血和脑脊液的乙脑特异性IgM抗体，阳性率高，可达97%，具有快速敏感的特点。