肌营养不良症需要与重症肌无力、有机磷酸酯类中毒、多发性硬化症等疾病进行鉴别。

1、重症肌无力：重症肌无力患者也会出现有类似于肌营养不良症的病症表现，如肌肉无力、肌张力下降等。但是重症肌无力患者大多还会伴随有复视、眼睑下垂等明显病征。并且配合肌电图、酶测试等检测进行鉴别。

2、有机磷酸酯类中毒：有机磷酸酯类中毒一般是由于接触含有有机磷酸酯类成分的物质而发生中毒性现象，患者病发时，也会出现有肌肉无力、手脚发抖等体表特征，但是通过血液检测可以与肌营养不良症进行明确诊断。

3、多发性硬化症：部分多发性硬化症后期患者，由于肌肉组织受损，通常也会出现有肌肉无力、麻木等临床表现，对于此类复杂病症患者，可以配合MRI、CT等医学影像学检查即可进行鉴别判断。