阵发性睡眠性血红蛋白尿症的并发症包括感染、血栓形成、肾功能衰竭、心力衰竭，出现时应引起重视。

1、感染：阵发性睡眠性血红蛋白尿症患者容易遭受各种感染，特别是呼吸道和泌尿道感染，感染，又可诱发血红蛋白尿发作。在我国，严重的感染往往是阵发性睡眠性血红蛋白尿症患者死亡的主要原因，患者可表现为发烧、感染部位疼痛，尿路感染可出现尿频、尿急、尿痛。

2、血栓形成：下肢静脉栓塞最多，其次为脑血栓形成，极个别有门静脉或肠系膜血栓形成。另外，也有下腔静脉、脾、肾静脉栓塞，1/4在肢体深静脉或浅静脉。患者表现为上肢肿胀、发绀、疼痛等。

3、肾功能衰竭：阵发性睡眠性血红蛋白尿症患者肾内有含铁血黄素沉着，但临床上发生肾功能损伤者并不多见。小部分病例有轻度蛋白尿、血中尿素氮增高。本病患者的肾功能逐渐减低，感染或严重的溶血可引起急性肾功能衰竭，但经处理往往可以恢复。患者可表现为恶心、纳差、乏力等症状。

4、心力衰竭：长期贫血可发生贫血性心脏病，严重者可致心力衰竭。患者可有气促、乏力、心悸等表现。