散发性脑炎需要与代谢性与中毒性脑病、中枢神经系统肿瘤、神经变性疾病等疾病进行鉴别。

1、代谢性与中毒性脑病：肝性脑病、肺性脑病等代谢性脑病或由于抗生素、化疗药物或免疫抑制剂等引起的中毒性脑病。患者通常具有其他系统原发性疾病或药物服用史，可通过实验室检查及病史进行鉴别。

2、中枢神经系统肿瘤：中枢神经系统肿瘤亦可引起与散发性脑炎相似的临床症状，尤其是弥漫性或多灶性脑肿瘤需要与散发性脑炎鉴别。通过临床表现易误诊，可通过影像学检查和实验室检查进行鉴别。

3、神经变性疾病：如路易体痴呆、遗传性小脑变性等疾病，患者同样可以表现出意识不清、昏迷等精神障碍症状。但二者病因不同，神经变性疾病主要由于神经老化、凋亡导致的神经退行性疾病，通常还具有智力、运动功能的损害，临床上可通过实验室抗体检查进行鉴别。