引起中毒性巨结肠的原因如下：

1、炎症性肠病：如溃疡性结肠炎、克罗恩病。

2、感染性肠炎：有细菌性难辨梭状芽孢杆菌性肠炎即假膜性肠炎、沙门菌感染性肠炎、志贺菌性肠炎、弯曲菌性肠炎、耶尔森菌性肠炎、病毒性（巨细胞病毒性肠炎、艾滋病病毒感染性肠炎）和寄生虫性（溶组织型阿米巴性肠炎、隐于包子虫性肠炎）。

3、医源性因素：钡剂灌肠或纤维肠镜检查过程中的注气和导管操作失误也会引发中毒性巨结肠。

4、药物因素：缺钾及抗胆碱能、抗腹泻药物或阿片类麻醉性镇痛剂，可降低肠肌张力抑制肠运动，可诱发本病。

5、暴饮暴食：患有炎症性肠病的群体常有消化不良，暴饮暴食，可诱发中毒性巨结肠的发生。

6、其他：如卡波西肉瘤（多病灶恶性新生血管增生症）、肠扭转、缺血性肠炎、憩室炎、结肠瘤引发的肠梗阻等。