变应性结膜炎需要与感染性结膜炎、药物毒性角结膜炎、干眼症等疾病鉴别判断。

1、感染性结膜炎：通常是由多种细菌、病毒等引起，常表现为眼红、流泪及分泌物增多等，一般较少出现眼痛、眼痒，而过敏性结膜炎常伴随眼痒症状。

2、药物毒性角结膜炎：表现为角膜下方点状上皮糜烂，严重者可呈弥漫性，进而出现角膜上皮缺损、基质浑浊及新生血管，上下睑结膜可有滤泡增生。一般患者有长期或过量使用抗病毒药物、抗过敏药物、甾体或非甾体类抗炎眼药等滴眼液的病史。因此依据病史、症状体征及相关检查可予鉴别。

3、干眼症：是结膜组织本身的病变而发生的结膜干燥现象，由全身性营养紊乱，维生素A缺乏所致，主要表现为眼睛干涩、易疲劳等症状，而变应性结膜炎以眼痒、眼红、流泪、眼分泌物增多等过敏性炎性反应症状为主。