肾性骨营养不良是慢性肾功能衰竭、慢性肾小管病变、透析治疗因素、铝潴留等原因引起。

1、慢性肾功能衰竭（慢性肾脏病）：慢性肾功能衰竭可产生代谢性酸中毒，尿磷排出减少，血液中磷增高，引起磷潴留；肠中对钙吸收减少，引起血钙降低，肾脏1-α羟化酶活性降低，引起活性维生素D减少，一系列代谢异常从而可导致肾性骨营养不良。

2、慢性肾小管病变：慢性肾小管病变导致此病多数为先天性肾小管功能缺陷，有多种原因引起肾小管功能减退、肾小管重吸收磷减少、血磷降低、钙磷乘积减少、维生素D代谢异常，继发甲旁亢而致此病。

3、透析治疗因素：透析疗法可缓解尿毒症，但可以增加透析性骨病发病率，透析2年以上的病人90%有骨病。透析液中钙离子浓度可影响此病发生，钙离子<1.3mmol/L时，骨病发生率增加，钙离子>1.99mmol/L时，又易于发生高钙血症和软组织钙化。

4、铝潴留：铝潴留也是引起肾性骨病的一个重要原因，可引起铝相关骨病，是肾性骨营养不良中的一个类型。由于患者铝排泄障碍，透析用水铝污染以及服用某些含有铝元素的药物等原因，可导致铝在骨中沉积，影响骨的矿化和更新，导致此病。