膜增生性肾小球肾炎有感染、血栓和栓塞、急性肾衰竭、蛋白质和脂肪代谢紊乱等并发症。

1、感染：感染是膜增生性肾小球肾炎患者常见并发症，与尿中免疫球蛋白的大量丢失、免疫功能紊乱、营养不良、激素和细胞毒药物的使用有关。感染发生的常见部位有呼吸道、泌尿道、皮肤和自发性腹膜炎等。患者可能会出现高热、发烧、腹痛等。

2、血栓和栓塞：多种因素如尿中丢失大量抗凝物质、高脂血症、血液浓缩等可使血液黏滞度升高。利尿剂、激素的使用以及血小板功能亢进可进一步加重高凝状态。患者可发生静脉或动脉的血栓形成或栓塞，其中以下肢静脉血栓和肾静脉血栓比较常见最常见。

3、急性肾衰竭：有效循环血容量不足可致肾血流量下降，尤其是重度水肿的膜增生性肾小球肾炎患者，给予强力利尿治疗时更易发生，患者可出现少尿或是无尿等。

4、蛋白质和脂肪代谢紊乱：多种原因可导致膜增生性肾小球肾炎患者出现低血浆白蛋白血症、高脂血症，蛋白、脂代谢异常。长期低蛋白血症可造成患者营养不良、机体抵抗力下降生长发育迟缓、内分泌紊乱等。