隐球菌病需要与肺结核和肺恶性肿瘤、结核性脑膜炎和脑肿瘤、粉刺、基底细胞瘤和类肉瘤等疾病进行鉴别。

1、肺结核和肺恶性肿瘤：肺新型隐球菌病应与肺部疾病相鉴别，如肺结核和肺恶性肿瘤等。可通过脑脊液的墨汁涂片、真菌培养进行鉴别。

2、结核性脑膜炎和脑肿瘤：中枢神经系统新型隐球菌病应与结核性脑膜炎和脑肿瘤等疾病相鉴别，可通过脑脊液的墨汁涂片、真菌培养进行鉴别。

3、粉刺、基底细胞瘤和类肉瘤：皮肤新型隐球菌病应与粉刺、基底细胞瘤和类肉瘤等疾病相鉴，可通过患者临床表现的不同进行鉴别。

4、骨骼、关节结核以及骨肿瘤：骨骼、关节新型隐球菌病应与骨骼、关节结核以及骨肿瘤等疾病相鉴别，可通过临床症状以及影像学检查进行鉴别。

5、粟粒性肺结核、结缔组织病和转移瘤：播散性新型隐球菌病应与粟粒性肺结核、结缔组织病和转移瘤等疾病相鉴别。