隐球菌病的治疗原则是以手术切除为主，根据病理决定是否行术后治疗，也可进行免疫增强剂治疗。主要有药物治疗和手术治疗。

一、药物治疗

常见药物：20%甘露醇、两性霉素B、氟胞嘧啶、氟康唑

1、20%甘露醇：针对颅高压症状的患者，可行甘露醇脱水治疗，能够明显缓解症状。

2、两性霉素B：是一种抗真菌药，对一些深部真菌有强大抑杀作用，如能杀灭新型隐球菌、白色念珠菌、皮炎芽生菌及组织胞浆菌等，它的活性超过其他抗真菌药。

3、氟胞嘧啶：抗真菌药，对念珠菌、隐球菌及地丝菌有良好的抑制作用，对部分曲茵及卡氏枝孢霉菌等也有作用，对其他真菌和细菌则无作用。

4、氟康唑：临床用于敏感菌所致的各种真菌感染，能特异有效地抑制真菌的细胞膜合成，可用于隐球菌引起的全身感染，包括隐球菌脑膜炎及肺部感染。

二、手术治疗

对局限性的皮肤隐球菌病、肺隐球菌病、骨隐球菌病及脑部隐球菌肉芽肿等，可采用手术切除，术后根据情况使用全身抗真菌剂治疗。