卡尔曼综合征患者可能会出现性腺发育不良、嗅觉缺失或减退、相关躯体异常等症状。

1、性腺发育不良：多数男性患者外生殖器呈幼稚状态，阴茎短小，睾丸小或隐睾；青春期第二性征发育缺如，例如无胡须、腋毛、阴毛生长，无变声等；女性患者内外生殖器发育不良，青春期时无乳房发育，无腋毛、阴毛生长，无月经来潮。

2、嗅觉缺失或减退：部分患者仅表现为嗅觉减退，严重者可表现为完全的嗅觉缺失，不能辨别香臭，。

3、相关躯体异常表现：KS除了GnRH缺乏及嗅觉缺失，可伴有各种各样的躯体异常，包括面中线发育缺陷，如唇裂、腭裂、掌骨短及肾脏发育异常等。神经系统的表现包括感觉性听力下降、镜像运动（联带运动）、眼球运动异常及小脑共济失调。