正常情况下，打骨钉矫正牙齿不会疼，但是在麻药作用消退后，可能会有酸痛感，需要一段时间适应。

打骨钉是一种小手术，风险小，时间短，术后不适应较少，可提高矫形效果及效率。牙齿正畸过程中，主要是在局麻下进行打骨钉的操作，医生可以选择表面麻醉剂的情况下，进行局部浸润麻醉，在麻醉状况下骨钉打到骨头中的过程不会疼痛。

麻药效果消退后，局部浸润麻醉的有效期或者发挥作用的时间，在2小时左右，2小时后麻药作用消退，会有疼痛感觉。如果骨钉已经受累，在牵引牙齿移位的情况下，会有酸痛感。

骨钉的作用是牵引相应的牙齿，向某些部位移动，这种牵引力比正畸治疗的钢丝或者托槽要大，因此打骨钉的部位会有酸痛，或者每次加力后，会有酸痛感，类似固定正畸时每次加力后的感觉，但这种隐隐的酸痛感，通常来说可以忍受。