甲状腺囊肿的发病原因通常有以下几种：

1、水质被污染：如果说喝了受到污染的饮用水，那么就很容易患上甲状腺囊肿这种疾病。所以喝水的时候一定要注意一下饮水的安全问题，尤其是在陌生地区，应该要看看饮用水是不是干净，水质是否合格，千万不要喝有污染的饮用水；

2、过多食用某些食物：很多食物对身体健康都有好处，而且口感也很不错，所以一部分人会长期吃这一类食物，比如说卷心菜和长萝卜。这些食物虽然很好，可是长期大量使用的话，有可能会导致甲状腺囊肿，因此一定要控制食用量；

3、碘摄入不足：如果说点元素的摄入量不足，那么也有可能会导致甲状腺囊肿发病。平时的时候少吃点碘也许感觉不到什么，但如果正处于生长发育期的孩子或者是怀孕的女性，对于碘的需求量会变大不少，这个时候如果不注意补充，还有可能会导致碘元素缺乏，引起甲状腺囊肿；

4、细菌感染：如果身体受到了某些细菌感染，那么患上甲状腺囊肿的几率也会增大。比如说身体受了外伤，没有做好日常的护理工作，以至于出现了细菌感染的情况，甲状腺囊肿也就随之出现了。