蛋白尿超过三个月不一定就是肾炎，具体需要结合各项检查结果综合分析。引起蛋白尿的原因较多，如剧烈运动、精神紧张、肾炎等。

1、是肾炎：如果蛋白尿超过三个月，同时做尿红细胞形态和肾穿刺活检，发现尿中红细胞以异常形态为主，且病理结果异常，则可以诊断为肾炎。此时的蛋白尿应该是肾小球的基底膜通透性增加所致；

5、不是肾炎：如果这三个月内经常剧烈运动，而且是在剧烈运动以后做尿常规，也可能会引起肾小球的基底膜通透性增加，导致尿蛋白三个月，但这是正常生理现象，不需要太过担心。此外，长期精神紧张、糖尿病肾病等，也可能会导致蛋白尿超过三个月，与肾炎无关。

因此，想要明确诊断肾炎，建议在医生进一步指导下完善尿红细胞形态检查、肾穿刺活检、腹部B超等检查。