大部分甲状腺萎缩的后果不严重，一般需要取决于萎缩程度以及是否及时治疗等情况。由于甲状腺萎缩会影响到身体健康，因此患者确诊后需要及时在医生指导下给予正确治疗。

1、一般不严重的情况：甲状腺萎缩主要指甲状腺体积缩小，若甲状腺萎缩程度较轻，如果没有影响到甲状腺功能，并且检查发现后及时给予干预，一般不严重，治疗过程中需要定期到医院复查和检查甲状腺功能。

2、可能严重的情况：若甲状腺萎缩面积较大，可能会影响到甲状腺功能使甲状腺素分泌减少引起甲状腺功能减退，多会出现情绪暴躁、食欲下降、身材肥胖等不适症状，不及时治疗可能会出现黏液性水肿，此时较为严重。

针对此种情况，可在医生指导下补充甲状腺激素药物治疗，如左甲状腺素钠片等，可以提高体内的甲状腺素水平，以维持甲状腺正常功能。

建议患者调整日常饮食习惯，以清淡饮食为主，避免抽烟、喝酒，同时在治疗期间需要注意监测甲状腺功能，以便及时调整药物剂量。