间质瘤的性质需要根据肿瘤的整体情况进行分析，可能是极低危恶性肿瘤，也可能是低危恶性肿瘤、中危恶性肿瘤或高危恶性肿瘤。

1、极低危恶性肿瘤：间质瘤来源于胃肠道黏膜Cajal细胞，好发于胃肠道，在开始发生时其生物学行为就具有恶性。但肿瘤直径小于2cm，危险程度极低，很少会出现转移或者扩散。

2、低危恶性肿瘤：直径为2.1-5cm，肿瘤恶性程度增加，有转移或者扩散风险，属于低危情况，需要加强动态观察。

3、中危恶性肿瘤：直径小于5cm，核分裂相数目明显增加，属于中危情况。

4、高危恶性肿瘤：超过5cm的间质瘤，尤其是小肠间质瘤，肿瘤细胞容易转移、扩散，尤其是经血液播散，属于高危情况。

因此，间质瘤的恶性程度与大小密切相关。一般2cm以下生物学行为缓慢，超过5cm危险性明显增加。