新生儿发热就诊后，通常需要进行以下检查：

1、全面体格检查：规范地进行呼吸系统、消化系统、泌尿系统、神经系统等的体格检查，有利于寻找感染的部位。对于免疫缺陷患儿尤其要注意是否有隐匿部位的感染，如肛门、腋窝、皮肤软组织感染等。

2、血常规：检查血液中的成分的变化，有利于炎症的诊断。

3、血清降钙素原检查：有利于检测出细菌感染程度。

4、C反应蛋白检查：超敏C蛋白的高低，有利于判断身体炎症的强弱。

5、尿常规：有利于尿路感染确诊。

6、粪便常规：检查大便中病原体，利于肠道感染的诊断。

7、胸部X线检查：观察肺部纹理及阴影，有利于呼吸系统疾病的诊断。

8、头颅核磁共振：有利于脑膜炎等脑部疾病的诊断。

9、腰椎穿刺：凡有发热病史的新生儿建议做腰椎穿刺术，检查脑脊液避免化脓性脑膜炎漏诊。