骨髓炎需要与蜂窝织炎、化脓性关节炎、风湿性关节炎、恶性骨肿瘤等疾病鉴别。

1、蜂窝织炎：由溶血性链球菌等致病细菌引起皮下组织化脓性的感染。蜂窝织炎一般表现为红肿、疼痛等症状，这与骨髓炎的症状很相似，但骨髓炎的红肿较轻，疼痛位置较深，可以通过MRI显示该病变部位并进行相关鉴别。

2、化脓性关节炎：化脓性关节炎的病变位于关节腔内，一般表现为关节不能活动、关节间隙，及关节腔内可抽出脓性液体，骨髓炎的病变部位多在骨骼两端即干骺端，可与骨髓炎进行鉴别。

3、风湿性关节炎：一般呈现关节疼痛。根据临床表现以及抗O实验阳性等实验室检查，与骨髓炎进行鉴别诊断。

4、恶性骨肿瘤：起病缓慢，病程较长。组织活检可帮助鉴别。