肠瘘需要与急性胰腺炎、急性阑尾炎、急性胃炎、胃穿孔进行鉴别。

1、急性胰腺炎：急性胰腺炎上腹部疼痛剧烈，且常向腰背部放射，甚至可引起休克，伴恶心、呕吐，但呕吐后腹痛不缓解，腹部CT可发现胰腺病变。两者通过CT、B超可进行鉴别。

2、急性阑尾炎：早期可出现剧烈上腹痛、恶心、呕吐，但随着病情进展，疼痛逐渐转向右下腹，且有固定的压痛及反跳痛，且多伴有发热。腹部CT可诊断和鉴别。

3、急性胃炎：患者早期可出现剧烈腹痛，呕吐后腹痛常缓解，腹痛程度也轻。胃镜、腹部CT可诊断和鉴别。

4、胃穿孔：胃肠穿孔后患者上腹部疼痛剧烈，甚至可引起休克，伴恶心、呕吐，腹痛持续不缓解且进行性加重。腹部CT可发现腹腔游离气体，也可用来诊断和鉴别。