根尖周炎需要与急性根尖周脓肿、急性牙周脓肿、牙髓炎等疾病相鉴别。

1、急性根尖周脓肿：急性根尖周脓肿的患牙一般多有较长时间的牙体缺损（如龋齿），或者曾有过牙痛、牙髓治疗史，一般多牙髓无活力，无深牙周袋，脓肿部位靠近根尖区，叩痛很重，牙齿松动较轻，X线片显示无明显异常表现，若为慢性根尖周炎急性发作，则会出现根尖区透射影像。

2、急性牙周脓肿：急性牙周脓肿通常会有长期的牙周炎病史，牙髓活力多为正常，有深牙周袋，脓肿的部位也靠近牙龈缘，疼痛较轻，牙齿松动比较明显，X线片显示牙槽骨破坏。

3、牙髓炎：牙髓炎多表现为自发痛，刺激痛，夜间加剧痛并且疼痛不能明确定位。而根尖周炎大多以咬合痛为主，疼痛一般也可以定位，拍摄X线片可见根尖区暗影。