低位肛瘘的高风险人群是糖尿病的患者、化疗患者、免疫抑制治疗的患者、生活习惯不良者、新生儿。

1、糖尿病的患者：如果血糖控制不好，血液中的糖浓度过高，会降低机体的免疫力，易于细菌繁殖，易导致肛腺发生感染、化脓，形成脓肿，破溃后形成肛瘘。

2、化疗患者：如肿瘤或血液病，在化疗过程中抵抗力降低，部分患者会出现肛周脓肿，而引起低位肛瘘的发生。

3、免疫抑制治疗的患者：如器官移植，会出现免疫力降低，多合并肛周脓肿，引起低位肛瘘。

4、生活习惯不良者：如过度饮酒或过多摄入辛辣刺激食物的患者，会反复刺激肛门，引起肛门局部的脓肿，引发低位肛瘘。

5、新生儿：新生儿体内来自母体中高浓度性激素，会使新生儿皮脂腺分泌亢进，易于引发肛周感染，但随着性激素水平的下降，肛周感染的几率随之也下降。