新生儿血小板减少性紫癜的病因是血小板破坏增加或消耗过多、血小板生成障碍或无效生成、血小板分布异常等。

1、血小板破坏增加或消耗过多：常见于免疫性破坏，某些免疫反应异常疾病，同族免疫性血小板减少、先天被动免疫性血小板减少、新生儿溶血症伴有血小板减少；宫内感染、生后感染等导致的感染相关血小板减少等；新生儿应用苯妥英钠、奎宁、奎尼丁、地高辛、吲哚美辛、利福平等药物所致的血小板减少；以及非免疫性破坏，如血管炎、动脉插管、体外循环等。还有血小板消耗过多，主要见于血栓性微血管病，均可引起该病的发生。

2、血小板生成障碍或无效生成：各种原因引起血小板生成障碍或者无效生成，巨核细胞生成减少，比如物理或化学因素、骨髓浸润性疾病、感染性疾病、遗传性疾病等。

3、血小板分布异常：各种原因导致的脾大，新生儿出现的少。