腺病毒感染需要鉴别的疾病有流行性感冒、支原体肺炎、轮状病毒性胃肠炎等，通过临床表现、实验室检查方面可鉴别。

1、流行性感冒：流行性感冒是由流感病毒引起的急性呼吸道的传染病，其潜伏期短、传染性强，主要表现为突发高热、头痛、乏力、肌肉酸痛等全身中毒症状，而呼吸道症状轻微。病原学检查可以鉴别。

2、支原体肺炎：支原体肺炎是由肺炎支原体引起的一种流行性感冒样急性呼吸道传染病，好发于青少年，约20％为隐性感染，可散发，亦可流行。临床表现为缓慢起病，发热、头痛、乏力、阵发性刺激性咳嗽，肺部体征不明显，病情常较轻，可表现为气管炎及鼻咽炎，病原学检查可见支原体阳性。

3、轮状病毒性胃肠炎：轮状病毒性胃肠炎是由轮状病毒引起的急性消化道传染病，主要经粪口传播，秋冬季节发病率高，是婴幼儿腹泻和成人病毒感染性腹泻的常见原因之一，可引起流行或大流行。临床表现为急性发热、呕吐、腹泻等，严重者可致脱水或电解质丢失，病程自限。