疱疹性口炎需要与以下疾病进行鉴别：

1、口炎型口疮：为散在分布的单个小溃疡，病程反复，不经过发病期。溃疡数量较多，主要分布于口腔内角化程度较差的黏膜处，不造成齦炎，儿童少见。

2、三叉神经带状疱疹：是由水痘-带状疱疹病毒引起的颜面皮肤和口腔黏膜的病损，疼痛剧烈，甚至损害愈合后在一段时期内仍有疼痛。本病任何年龄都可发生，愈后不再复发。

3、手足口病：因感染柯萨奇病毒A16所引起的皮肤黏膜病，但口腔损害比皮肤重。前驱症状有发热、困倦与局部淋巴结肿大:然后在口腔黏膜、手掌、足底出现散在水疱、丘疹与斑疹，数量不等。

4、疱疹性咽峡炎：由柯萨奇病毒A所引起的口腔疱疹损害，临床表现较似急性疱疹性龈口炎，但前驱期症状和全身反应都较轻。

5、多形性红斑：是一组累及皮肤和黏膜，以靶形或虹膜状红斑为典型皮损的急性炎症性皮肤黏膜病。病损易出血，在唇部常形成较厚的黑紫色血痴。皮损常对称分布于手背足背、前臂，损害为红斑丘疹、水疱、大疱或血疱等。