小儿先天性胆总管囊肿需要做的检查有生化检查、B超检查、CT检查、逆行性胰胆管造影（内镜造影）及经皮肝胆管造影检查等。

1、生化检查：包括血清胆红素，主要是直接胆红素明显升高，碱性磷酸酶和γ-谷氨酰转肽酶也升高。

2、B超检查：是最为简便且无创的检查手段，可初步获得诊断。可见肝下方界限清楚的低回声区，可确定囊肿的大小，胆管远端的狭窄程度，并可知肝内胆管扩张的程度和范围。

3、CT检查：可明确肝内外胆管有无扩张、扩张的部位、程度及形态、位置，胆总管远端狭窄的程度以及有无肝内胆管扩张，扩张的形态及部位等，有助于术式的选择。

4、逆行性胰胆管造影内镜造影：用小儿十二指肠纤维内镜经十二指肠乳头插入导管造影，可显示胰胆管全貌，尤其对胰胆管合流异常更能清晰显影，对治疗方法的选择提供可靠依据。

5、经皮肝胆管造影检查：通过该项检查可了解肝内胆管囊性扩张的部位，可为手术选择提供指导；了解有无胰腺管的合流异常及胰胆管远端的病理变化；了解远近端胆管的狭窄程度；可采取胆汁，进行细菌学检查。