先天性睾丸发育不全的治疗方式包括药物治疗、手术治疗。

一、药物治疗：常用睾酮、甲睾酮、环戊丙酸睾酮。

1、睾酮：包括睾酮胶丸、十一酸睾酮、睾酮贴剂，具体用药剂量应根据每个患者对药物的反映情况而加以适当调整，有效治疗男性性腺功能减退，提高雄激素水平。

2、甲睾酮：包括片剂、贴剂，常用于男性性腺功能低下者激素替代治疗，注意应用贴剂时，应每日更换用药部位，以避免或减少局部皮肤刺激。

3、环戊丙酸睾酮：有效治疗男性原发性性腺功能减退，男性乳腺癌者禁用，患有严重心血管、肝脏、肾脏疾病患者禁用。

二、手术治疗

1、显微取精术：通过显微取精-试管婴儿辅助生殖技术，帮助患者解决不育问题。

2、乳房切除整形术：男性乳房发育一般不受激素治疗的影响，因此可采用乳房切除或抽吸术，解决男性乳房发育的问题。