扁平疣通过药物治疗、冷冻治疗、激光治疗等方法治疗最有效，如果症状加重或长时间未得到缓解，建议前往医院就诊，尽早治疗。

1、药物治疗：通常可以在医生指导下使用水杨酸软膏、维A酸乳膏、咪喹莫特乳膏等药物进行涂抹治疗；

2、冷冻治疗：医生通常采用液氨产生低温，使皮损坏死、脱落，该方法可能需要多次治疗以达到治疗效果。临床常采用棉签蘸取液氮治疗扁平疣。因为这种方法会很痛苦，所以通常并不适用于年龄较小的患者；

3、激光治疗：通常采用脉冲染料激光，通过高温使皮损组织坏死、脱落。该疗法可能会导致疼痛和疤痕；

4、光动力疗法：可用于部分扁平疣的治疗。方法为局部使用光敏剂如氨基酮戊酸(ALA)后进行光照，可使皮损处感染的细胞死亡。

建议在医生指导下，根据自身病情，选择合适的治疗方法。