寰枢脱位可由外伤直接暴力引起，也可因寰枕融合、C2~C3融合等先天性畸形所致。感染性炎症、类风湿性关节炎侵袭、肿瘤、结核等疾病也可引起骨质破坏，而出现寰枢脱位，具体原因如下：

一、疾病因素：

1、寰枕融合、C2~C3融合：先天性畸形，如寰枕融合和C2~C3融合可引起寰枢椎脱位。寰枕融合及C2~C3融合，会导致寰枕关节和C2~C3关节活动丧失。在头颈部活动时，寰枢关节活动出现代偿、承受应力增大，从而寰椎横韧带和翼状韧带的紧张，日积月累，韧带逐渐被拉长松弛，寰枢关节不稳定，进而出现寰枢脱位或是半脱位。

2、炎症性病变：感染性炎症可以导致寰枢椎脱位，绝大多数发生在儿童时期，通常被称为自发性寰枢椎脱位。是因为炎性积液进入齿突周围和寰枢外侧关节，炎症因素导致关节囊和周围韧带松弛，充血性骨质脱钙，引起骨软化和纤维骨连接减弱，从而导致寰枢脱位。成人也会因为类风湿关节炎出现寰枢椎脱位，类风湿破坏性炎症改变和继发于脉管炎的组织变性导致韧带和关节囊松弛，还可能会因为类风湿关节炎引起邻近骨破坏和关节滑膜肉芽组织形成；寰椎侧块骨移位或遭受破坏，久而久之出现寰枢脱位。

3、结核和肿瘤等直接破坏骨性和（或）韧带结构，也可引起寰枢椎脱位与不稳。

二、非疾病因素：

由于头部突然遭受前屈受立作用，可造成横韧带断裂。另外，垂直暴力作用造成寰椎爆裂性骨折时，寰椎侧块和椎弓骨折分离移位也可造成横韧带断裂。当横韧带损伤或断裂时，即可出现寰枢椎脱位或半脱位。