药物仍然是治疗疟疾的最主要手段。按抗疟药对疟原虫不同虫期的作用，可将其分为杀灭红细胞外期裂殖体及休眠子的抗复发药，如磷酸伯氨喹片；杀灭红细胞内裂体增殖期的抗临床发作药，如磷酸氯喹片、磷酸咯萘啶注射液、青蒿素类。

疟疾治疗应包括对现症病人的治疗和疟疾发作休止期的治疗。休止期的治疗是指在疟疾传播休止期，对1-2年内有疟疾史和带虫者的治疗，以控制间日疟的复发和减少传染源。目前抗疟药的使用基本遵循WHO推测的青蒿素复方，即青蒿素的联合用药策略和原则，以延长抗疟药的使用寿命。

对间日疟、卵形疟、三日疟和诺氏疟患者，选用氯喹进行治疗；如上述疟原虫已对磷酸氯喹片产生了抗性，则采用青蒿素联合用药。抗间日疟复发可用磷酸伯氨喹片加乙胺嘧啶片、青蒿琥酯片加磷酸伯氨喹片效果更佳；恶性疟可单服磷酸伯氨喹片，抗氯喹的恶性疟则同样采用青蒿素联合用药，如蒿甲醚加本芴醇、青蒿酯加阿莫地喹、青蒿酯加甲氟喹;二氢青蒿素加磷酸哌喹;青蒿酯加磺胺多辛/乙胺嘧啶;重症疟疾首选青蒿素类药物肌注或静脉给药，如蒿甲醚油剂肌注、青蒿琥酯钠静注或静注双氢青蒿素加二盐酸喹啉；此外，青蒿素类药物的栓剂适用于不能口服药物的患者。上述各种抗疟药物必须足量并服完全程才能达到根治疟疾的目的。

参考资料：[1]诸欣平，苏川.人体寄生虫学.第8版[M].北京.人民卫生出版社.2013.