新生儿呼吸窘迫综合征患者在应用常频机械通气后常见的并发症有呼吸机相关肺炎、肺气漏、支气管肺发育不良等，具体如下：

1、呼吸机相关肺炎：是最常见的并发症，由于长时间气管插管和（或）应用呼吸机引起的继发性肺内感染，可加重原发疾病，影响呼吸机的撤离。常见致病菌有克雷伯杆菌、铜绿假单胞菌、肠杆菌及不动杆菌。

2、肺气漏：多由常频机械通气的压力过高所致。包括肺间质气肿、气胸、气腹、心包积气、纵隔积气、皮下气肿和空气栓塞。

3、支气管肺发育不良：由于长时间机械通气、吸入高浓度氧或感染等因素所致。目前将其定义为生后28天或纠正胎龄（胎龄+日龄）36周时仍需吸氧并伴胸片异常。主要病理变化为肺泡发育障碍和肺间质纤维化。

4、早产儿视网膜病：除机械通气外，主要为长时间吸入高浓度氧所致，其病理特征为晶状体后纤维组织增生：严重病例可失明。

5、其他：气道损伤、心排血量减少等。

参考资料：[1]王卫平.儿科学.第8版[M].北京.人民卫生出版社.2013.