有肛瘘是否可以做肠镜，需要根据病情稳定性及检查目的进行判断，最终是否进行肠镜检查应当听从医生的建议，评估风险和益处。

1、病情稳定性：如果肛瘘发作频繁或炎症活跃，可能会导致肛门周围组织肿胀、疼痛和炎症。在这种情况下，可能不适合进行肠镜检查，以避免进一步刺激和加重症状。如果肛瘘稳定，症状较轻，可以考虑做肠镜。

2、检查目的：肠镜检查可以帮助了解肠道内部情况，以及走向和长度，并判断是否合并有其他疾病，起到一定的辅助诊断作用。如果怀疑肛瘘患者可能患有肠炎、肠息肉等其他疾病，则可以做肠镜检查，反之则不必做该检查。

如果决定进行肠镜检查，患者需要与医生说明自己的病情和症状，包括肛瘘的特点和以往的治疗情况，并在医生指导下根据具体的情况，明确是否需要，以及是否符合进行肠镜检查的要求。