临床上没有女性肾萎缩最好的治疗方法的说法，可以通过饮食调理、药物治疗、手术治疗等方法来进行治疗，可以达到比较好的效果。

1、饮食调理：摄入过多的盐会导致水钠潴留，加重肾脏负担，应该限制盐的摄入量，以控制血压，减轻肾脏负荷。适当地补充优质蛋白质以及维生素，有助于补充身体所需要的营养，一定程度上促进病情的恢复；

2、药物治疗：对于由免疫系统异常引起的肾萎缩，可以在医生的指导下使用醋酸泼尼松片、吗替麦考酚酯片等药物进行治疗；

3、手术治疗：对于肾功能严重受损的女性肾萎缩患者，可以在医生的指导下进行手术治疗，如肾动脉支架植入术、血管成形术、肾移植等。

需要怎么选择治疗方式，应该根据患者的病情来决定，在医生的指导下选择合适的治疗方式来改善疾病症状。