卵巢囊肿治疗方式的选择应根据发生囊肿的年龄，卵巢囊肿的性质、体积大小、生长速度、是否保留生育功能来决定，一般以手术治疗为主。

一、一般治疗

若患者无自觉症状，囊肿较小，可注意休息，规律作息，定期观察随访。如持续存在达三个月以上或者观察期间缓慢增长，则需要手术治疗。

二、药物治疗

常见药物：孕三烯酮、阿奇霉素、奥硝唑

1、如果为卵巢子宫内膜异位囊肿（巧克力囊肿），可口服孕三烯酮。

2、如果是卵巢炎症性囊肿，可口服头孢类抗生素、阿奇霉素或奥硝唑。

三、手术治疗

卵巢囊肿以手术治疗为主，其他治疗为辅。

1、良性卵巢囊肿：（1）卵巢囊肿切除术，年轻患者尤其是绝经前患者多采用此种术式。（2）输卵管卵巢切除术，适用年龄较大（45岁以上）或绝经后患者。

2、恶性卵巢肿瘤：多采取肿瘤细胞减灭术和盆腔淋巴结清扫术，术后可能需要进行化疗等辅助治疗。

卵巢囊肿越早治疗效果越好，并且良性囊肿通过手术切除可治愈，恶性肿瘤的治疗效果与恶性程度与病理类型有关，恶性程度越低，效果越好。