肾小球肾炎需要与急性肾小管坏死、急性过敏性间质性肾炎、梗阻性肾病、慢性肾盂肾炎等疾病鉴别。

1、急性肾小管坏死：常有明确的肾缺血，如休克、脱水，或肾毒性药物，如肾毒性抗生素，或肾小管堵塞，如血管内溶血等诱因,临床上以肾小管损害为主(尿钠增加、低比重尿及低渗透玉尿)，一般无急性肾炎综合征表现。

2、急性过敏性间质性肾炎：常有明确的用药史及部分患者有药物过敏反应，如低热、皮疹等、血和尿嗜酸性粒细胞增加等，可进行鉴别，必要时依靠肾活检确诊。

3、梗阻性肾病：患者常突发或急骤出现无尿，但无急性肾炎综合征表现，B超、膀胱镜检查或逆行尿路造影可证实尿路梗阻的存在。

4、慢性肾盂肾炎：多有反复发作的泌尿系统感染史，并有影像学及肾功能异常，尿沉渣中常有白细跑，尿细菌学检查阳性可鉴别。