骨母细胞瘤需要与以下疾病鉴别：

1、骨肉瘤：由于成骨性肿瘤的瘤谱变异范围大，从普通良性的骨母细胞瘤到完全恶性的骨肉瘤的变异使得诊断和处理变得复杂。需在镜下仔细鉴别，凡是细胞结构异常、细胞核不典型、核分裂异常等存在者，均属于骨肉瘤。

2、骨样骨瘤：病灶的大小及有无瘤巢是鉴别的主要依据，骨样骨瘤多<2cm，周边骨质增生硬化明显，很少表现为膨胀性病变。

3、骨巨细胞瘤：多发生于骨骺愈合后的患者，位于骨端呈膨胀性骨破坏，与骨的长轴垂直，周围无骨质增生硬化，不出现骨膜反应。MRI显示肿瘤边界清楚，少数病灶边缘有低信号的环圈，瘤体信号无明显特征性。

4、动脉瘤样骨囊肿：当骨母细胞瘤合并动脉瘤样骨囊肿两者鉴别困难，一般而言，骨母细胞瘤容易出现瘤内钙化或骨化是其相对特征。

5、脊柱转移瘤：多有原发肿瘤病史，可多发，多见于中老年患者，MRI上转移瘤椎体破坏更明显，椎间盘常保持完整，多个椎体及椎体附件同时受累多见，软组织肿块更明显。

6、脊柱结核：临床有结核中毒症状，其他部位如肺等有结核病灶，结核菌素试验结果阳性等有助于诊断；MRI表现为相邻椎体破坏，椎间盘破坏，一般伴有不强化的椎旁脓肿。