食管间质瘤的治疗方法包括药物治疗、手术治疗等。

一、药物治疗

1、奥美拉唑、泮托拉唑：均属于质子泵抑制剂，可以抑制胃酸的分泌，促进病灶处损伤粘膜的血液循环。泮托拉唑偶有头晕、失眠、嗜睡、恶心、腹泻、便秘、皮疹、肌肉疼痛等症状，哺乳期妇女、妊娠头3个月妇女禁用此药；奥美拉唑有口干、轻度恶心、呕吐、腹胀、便秘、腹泻、腹痛等不良反应，对奥美拉唑过敏者、严重肾功能不全者、婴幼儿、哺乳妇女禁用此药。

2、硫糖铝、替普瑞酮：属于黏膜保护药，可以保护食管的黏膜，促进食管粘膜的恢复，增强黏膜的抵抗力。硫糖铝常见便秘等不良反应，肾功能不全者慎用；替普瑞酮可出现便秘、腹胀、腹泻、口渴、恶心、腹痛等不良反应，当出现皮疹、全身瘙痒等皮肤症状时，应停止用药。

3、伊马替尼和舒尼替尼：随着基因分型检测和分子靶向治疗的进展与靶向药物一线伊马替尼和二线舒尼替尼的临床应用，靶向治疗联合手术对选择性局部晚期胃肠道间质瘤可以获得满意效果，是晚期、不可切除或复发转移性胃肠道间质瘤的主要治疗模式。

二、手术治疗

食管间质瘤切除术：内镜下切除或手术切除是食管间质瘤的首选治疗方法。确定切除范围，直接切除肿块，治愈率较高。

一般来说患者通过积极的干预治疗，可以明显的改善生活质量，复发的情况极少，治愈的患者基本能恢复到正常的生活水平。