线粒体脑肌病的治疗方法包括一般治疗、急症治疗、药物治疗等。

一、一般治疗

平时需要多注意饮食调节，多吃一些高蛋白、高碳水化合物的食物。适当的进行运动，还需要放松心情，增强自身抵抗力。

二、急症治疗

1、治疗时需要根据所出现的症状选择相应的药物进行治疗，同时还需要密切监测血压和血氧饱和度。

2、出现卒中样发作时，可以在医生的指导下使用L-精氨酸酸治疗，在使用的时候需要多注意观察患者的生命体征，及时进行肝肾功能检测。

3、出现急性水肿或者是病灶比较大时，也可以使用一些糖皮质激素类药物进行治疗。但是在治疗时一定要多注意患者的血压及血氧饱和度。

4、出现癫痫发作时，可以使用苯妥英钠对大脑皮层运动区有高度的选择性抑制作用，对癫痫大发作的效果较好；癫痫小发作时可以选用乙琥胺治疗。另外抗癫痫的药物还有丙戊酸钠、卡马西平等。

三、药物治疗

1、三磷酸腺苷：可给予静脉滴注三磷酸腺苷、辅酶A。三磷酸腺苷用于进行性肌萎缩，脑出血后遗症，心功能不全。可能会出现的不良反应有胃肠道反应、过敏等。

2、辅酶Q10：一种辅酶类的药物，用在一些疾病的辅助治疗中，如对于病毒性心肌炎、肝炎、肝功能不全、慢性心功能不全或者恶性肿瘤等，都能起到一定辅助的保心、保肝作用。常见不良反应有胃部不适、食欲减退、恶心或者腹泻、心慌等。有极少数的患者对于这种药物有轻度过敏，可能会出现皮疹等情况。

3、维生素B族：可以提高人体的免疫力，缓解精神压力，提高胃肠道的消化、吸收作用等。大剂量使用，可能会出现烦躁、疲倦，会影响食欲，出现食欲减退，另外偶有皮肤潮红或者是瘙痒等一些过敏的反应。

4、左卡尼汀：可以促进代谢，改善能量代谢。用以预防左卡尼汀欠缺，如慢性肾衰患者因血透引发的左卡尼汀欠缺；改进心脏供血不足，抗心绞痛等。该药副作用为偶有口干舌燥、消化道轻微不适感，断药后可自主消退。

四、手术治疗

为了缓解慢性进行性眼外肌瘫痪或Kearns-Sayre综合征患者上睑下垂以及斜视症状，大部分的患者可以进行手术治疗。当Kearns-Sayre综合征患者出现吞咽困难，切除部分肌肉后可改善。线粒体耳聋患者佩戴助听器无效时，可植入耳蜗。存在线粒体心肌病患者，经过评估后可以进行心脏移植。当Kearns-Sayre综合征患者出现重度心脏传导阻滞时可用心脏起搏器。

一般对于偏瘫的患者，可以进行康复训练。但是康复训练的具体内容，需要在医生面诊后才可以确定，以免使用的方法不当，起到反作用。