含牙囊肿的并发症包括釉细胞瘤、牙齿咬合紊乱、鼻窦炎、复视。

1、釉细胞瘤：主要发病原因是成釉器在胚胎发育过程中残留在下颌骨中，最后发生瘤样变，从而导致成釉细胞瘤发生，发病率低，极少病例发展为成釉细胞瘤。早期无自觉症状，后期颌骨膨隆，多向唇颊侧发展，压迫性生长可引起面部畸形和功能障碍。

2、牙齿咬合紊乱：指咬合接触不均匀，主要表现为牙齿排列或咬合时偏侧或疼痛,严重时可能出现张口受限或困难,引起咀嚼和进食等一系列问题。

3、鼻窦炎：主要表现为持续较重的上呼吸道感染，鼻堵、脓涕、头痛等，严重者可引起颅、眼、肺等部位并发症，导致视力改变，甚至感染加重而死亡。

4、复视：主要指两眼看一物体时常感觉是两个物体的异常现象，可分为单眼与双眼复视，严重时可能影响正常生活。