阴道横隔一般通过手术治疗纠正畸形，可有效的消除病症。若患者病情较轻，可使用药物治疗暂时不进行手术治疗。

一、药物治疗：常见药物包括止痛化徽胶囊、益母草胶囊。

1、止痛化徽胶囊：主要用于横隔较薄且无巨大疼痛感的患者，可以对月经不调者进行治疗。

2、益母草胶囊：对一些症状较轻者进行治疗，可以活血化瘀、调理月经。

二、手术治疗

1、完全性横隔患者或有明显症状的不全性横隔患者，手术切除横隔，缝合、止血。

2、无明显症状的不完全性横隔患者，可在分娩时治疗。若横隔薄者可于胎先露部下降压迫横隔时切开横隔，胎儿娩出后再切除横隔，横隔厚者应行剖宫产术。

3、术后要定期扩张阴道或放置阴道模具，防止横隔残端挛缩。

阴道横隔一般预后良好，若阴道横隔患者手术后仍不能顺利分娩，则应该选择剖宫产。