严重急性呼吸综合征需要与以下疾病鉴别：

1、肺结核：多有全身中毒症状，午后低热、盗汗、疲乏、无力、体重减轻、失眠、心悸等症状。X线胸片可见病变多在肺尖或锁骨上下，密度不匀，消散缓慢，且可形成空洞或肺内播散。痰中可找到结核杆菌，常规抗菌药物治疗无效。

2、肺癌：常有吸烟史，有咳嗽、咳痰、痰中带血症状。血白细胞计数不高，痰中若发现癌细胞可以确诊。可伴发阻塞性肺炎，经抗生素治疗后炎症不易消散，或可见肺门淋巴结肿大，有时出现肺不张。必要时做CT、MRI、纤维支气管镜和痰脱落细胞等检查。

3、急性肺脓肿：早期临床表现相似，随着病程进展，咳出大量脓臭痰为肺脓肿的特征。X线片显示脓腔及液平面。

4、肺血栓栓塞：肺血栓栓塞症多有静脉血栓的危险因素，可发生咯血、晕厥，呼吸困难较明显，颈静脉充盈。X线胸片示局部肺纹理减少，可见尖端指向肺门的楔形阴影，常见低氧血症及低碳酸血症。D-二聚体、CT肺动脉造影、放射性核素肺通气/血流灌注扫描和MRI等检查可帮助进行鉴别。

5、其他病毒性肺炎：主要依靠病毒核酸和抗体检测鉴别。