扁桃体溃疡需要与以下几种疾病相鉴别：

1、急性化脓性咽喉炎：该病有类似的咽痛、高热等症状，体检检查病变部位在咽喉部，但腭扁桃体未见明显溃疡，通过体格检查可以鉴别诊断。

2、樊尚咽峡炎：由梭形杆菌及樊尚螺旋体感染的亚急性扁桃体炎。该病有咽痛、低热症状，并且扁桃体上有灰色或黄色假膜，呈腐肉状，有臭味。检查可见梭形杆菌和樊尚螺旋体，急性扁桃体溃疡可为双侧扁桃体同时发病。

3、咽白喉：是由白喉杆菌引起的急性传染病，以咽部黏膜形成灰白色假膜及白喉外毒素所致的全身毒血症为主要特征。该病有咽痛，但咽痛较轻。鼻、咽等咽拭子涂片及培养可找到白喉杆菌，呈流行性发作，可与扁桃体溃疡相鉴别。

4、猩红热：突发咽痛、高热等症状，扁桃体充血肿胀，可见灰色或褐色假膜。检查可见链球菌、皮疹、杨梅舌。流行性发作，可和扁桃体溃疡相鉴别。

5、粒细胞缺乏性咽峡炎：该病起病急，多伴有高热、精神萎靡，迅速出现衰竭状态，局部假膜有黑绿色坏死组织，假膜下有溃疡，血白细胞数极低，可和扁桃体溃疡相鉴别。

6、扁桃体肿瘤：当一侧扁桃体迅速增大或扁桃体肿大并且有溃疡，均应考虑肿瘤的可能性。需要做活检确诊，和扁桃体溃疡相鉴别。

7、单核细胞增多症性咽峡炎：该病发病急，小儿多见，一侧扁桃体红肿，伴全身淋巴结肿大，单核细胞可达40%-80%，异常淋巴细胞占白细胞总数10%以上。扁桃体未见明显溃疡，可与之鉴别。