小儿支原体肺炎需要与以下几种疾病进行鉴别：

1、肺结核：由结核分枝杆菌引起的肺部疾病，通过呼吸道传播。表现为午后低热、盗汗、疲乏无力、咳嗽、体重减轻、失眠等症状。痰中可找到结核分枝杆菌，有助于鉴别。

2、嗜酸性粒细胞性肺炎：可急性也可慢性起病，患者多出现发热、咳嗽、呼吸困难等症状。肺部有嗜酸性粒细胞浸润，伴或不伴有外周血嗜酸性粒细胞增多，血清特异性抗体测定阴性。

3、慢性支气管炎：是气管、支气管黏膜及周围组织的慢性非特异性炎症。病程长，反复急性发作，以咳嗽、咳痰为主，通过支原体检测为阴性可鉴别。

4、咳嗽变异性哮喘：以慢性咳嗽为主要临床表现，肺功能和气道反应性测定是诊断咳嗽变异性哮喘重要指标。支气管激发试验及支气管舒张试验均阳性。

5、支气管异物：剧烈咳嗽需要和支气管异物鉴别，后者多无感染病史，突然剧烈呛咳，双侧呼吸音不对称，胸透或肺部CT可鉴别。