乳头内陷的病因可分为先天性和继发性，以先天性乳头内陷多见。先天因素为先天发育不良，后天因素包括既往乳房手术、浆细胞性乳腺炎、乳腺肿瘤等，这些因素均可不同程度地侵犯乳房的纤维组织导致其收缩而造成乳头内陷。

1、先天性乳头凹陷：乳头凹陷的中间凹陷内部有纤维束牵拉，乳腺导管短缩，发育不良，乳头下方组织空虚，缺乏支撑组织。

2、既往乳房手术：既往乳房相关手术伤及乳腺管、韧带或筋膜导致挛缩，牵拉相连的乳头，导致乳头内陷。

3、浆细胞性乳腺炎：由于乳腺导管纤维增生及炎性反应可导致乳管缩短，乳头凹陷，部分病例可出现皮肤橘皮样改变。既可以为乳头内陷的病因，也可以为乳头内陷处理不当的结果。

4、乳腺肿瘤：包括乳腺癌、乳腺叶状瘤、浸润性的输乳管肿瘤等，由于肿瘤侵犯，引起乳腺管、韧带或筋膜挛缩，影响受其牵拉的乳头，导致乳头内陷。

5、其他疾病：包括下垂的巨大乳房（包括男性）、乳房外伤、乳腺结核病、乳房外湿疹样癌等。