日本血吸虫主要寄生在肠系膜下静脉与直肠痔上静脉内。虫卵沉积于宿主肠壁黏膜下层，并可顺门静脉血流至肝内分支，故病变以肝与结肠最显著。

1、结肠：病变以直肠、乙状结肠、降结肠为最重横结肠、阑尾次之。早期黏膜充血水肿、片状出血、浅表溃疡等。慢性患者由于纤维组织增生肠壁增厚，可引起肠息肉和结肠狭窄。肠系膜增厚、缩短，淋巴结肿大与网膜缠结成团，可发生肠梗阻虫卵沉积于阑尾，易诱发阑尾炎。

2、肝脏：早期肝脏充血肿胀，表面可见黄褐色粟粒样虫卵结节；晚期由于虫卵结节形成纤维组织，在肝内门静脉周围出现广泛的纤维化，肝切面可见白色的纤维素，从不同角度插入肝内，呈典型的干线状纤维化。因血液循环障碍，导致肝细胞萎缩表面有大小不等结节，凹凸不平。由于门静脉血管壁增厚，门静脉细支发生窦前阻塞，引起门静脉高压，致使腹壁、食管、胃底静脉曲张。

3、脾脏：早期轻度充血、水肿、质软，晚期肝硬化引起门静脉高压、脾淤血、组织增生、纤维化、血栓形成，呈进行性增大，可出现巨脾，继发脾功能亢进。

虫卵或(和)成虫寄生在门静脉系统之外的器官病变为异位损害。以肺、脑较多见，肺部病变为间质性虫卵肉芽肿伴周围肺泡炎性浸润。脑部病变主要是顶叶与叶的虫卵肉芽肿，多发生在感染后6个月至1年内。

参考资料：[1]李兰娟,任红.传染病学.第9版[M].北京.人民卫生出版社.2018.