人格障碍的病的生物学因素与遗传、神经生化、病理生理等因素相关，一般认为是在大脑先天性缺陷的基础上，遭受环境有害因素的影响而形成的。

1、遗传因素：遗传因素与人格的发展和形成密切相关。双生子研究发现同卵双生子人格障碍的同病率高达67%，异卵双生子的同病率则为31%。寄养子研究发现，有遗传背景的寄养子成年后与正常对照组相比，仍有较高的人格障碍发生率。一项研究显示，单胺氧化酶A基因多态性与反社会特质相关，这种特质包括攻击行为，但是仅仅当有儿童期虐待时才相关。这表明人格障碍可能是遗传及环境相互作用的结果。

2、神经生化因素：边缘系统的γ-氨基丁酸能、谷氨酸能、胆碱能环路的过度反应可能介导情绪的不稳定，这种反应过度导致对环境情绪刺激反应和敏感性增加，情绪不稳定型人格障碍可能与之相关。杏仁核过度反应、前额叶抑制降低可能与边缘型人格障碍及反社会型人格障碍的冲动攻击性阈值较低相关。前额叶皮质的多巴胺能和去甲肾上腺能活性降低，可能与分裂样人格障碍患者的认知缺陷有关。

3、病理生理因素：脑电图研究证明，人格障碍者的双亲中，脑电图异常率较高。50%人格障碍者的脑电图发现有慢波出现，与儿童脑电图近似。故有学者认为人格障碍是大脑发育成熟延迟的表现。