百日咳鲍特菌俗称百日咳杆菌，是人类百日咳的病原体。人类是百日咳鲍特菌唯一宿主。百日咳鲍特菌主要侵犯婴幼儿呼吸道。感染早期有轻度咳嗽，1-2周后出现阵发性痉挛性咳嗽，可持续数周，随后进入恢复期全病程可达几个月。临床病程可分卡他期、痉咳期、恢复期。

1、卡他期：类似普通感冒，有低热、打喷嚏、轻度咳嗽，可持续1-2周，此期传染性很强。

2、痉咳期：出现阵发性痉挛性咳嗽，常伴吸气吼声（鸡鸣样吼声）同时常有呕吐呼吸困难发绀等症状。每日激烈阵咳可达10-20次，一般持续1-6周。

3、恢复期：咳逐渐减轻，完全恢复需数周至数月不等。因病程较长，故称百日咳。

若治疗不及时，少数患者可发生肺炎链球菌金黄色葡萄球菌和溶血性链球菌等继发感染，出现肺炎、中耳炎等。