肺炎嗜衣原体人生物型寄生于人类，在人与人之间经飞沫或呼吸道分泌物传播。扩散较为缓慢，具有散发和流行交替出现的特点。约有50%的成人受到过肺炎嗜衣原体感染，大部分为亚临床型。

肺炎嗜衣原体是呼吸道疾病的重要病原体，易引起肺炎、支气管炎、咽炎和鼻窦炎等。起病缓慢，临床症状与肺炎支原体相似，表现为咽痛、咳嗽、咳痰、发热等，一般症状较轻。大约4.5%-25%肺炎嗜衣原体感染的病人出现严重的哮喘症状。

病原体存在的持续性及隐蔽性，可造成机体组织的慢性病理损伤。流行病学调查证实肺炎嗜衣原体与冠心病、动脉粥样硬化等慢性病的发生密切相关。机体感染肺炎嗜衣原体后以细胞免疫为主，体液免疫为辅，但免疫力不持久，可重复感染。