自身免疫性肝炎的病因通常包括遗传易感性、环境促发因素及抗原交叉反应以及免疫功能异常等。

1、遗传易感性：主要与人类白细胞抗原I类分子及Ⅱ类分子有关；

2、环境促发因素及抗原交叉反应：一些因素如感染(麻疹病毒、肝炎病毒和EB病毒感染等)药物和毒素、交叉抗原等，可能诱导自身抗体的产生和打破自身耐受，促进抗体依赖的细胞毒性和异常HLA抗原的表达，进而引起T细胞的细胞毒性，发生针对肝的自身免疫反应；

3、免疫功能异常：从体液免疫角度，患者可能具有抑制性T细胞功能缺陷，不能正常抑制对自身抗原有反应性的B细胞，后者产生针对自身抗原的自身抗体，进一步可通过抗体依赖的细胞介导的细胞毒作用而使自身细胞遭到破坏。

参考资料：[1]陈灏珠，林果为，王吉耀.实用内科学（下册）.第14版[M].北京.人民卫生出版社.2013.