牙髓坏死后，根管内壁上附着有大量坏死组织因此细菌生物膜可以在根管内广泛存在。根管内大部分部位的细菌可以清除，但以下部位难以清除：

1、管间交通支：在同一牙根内不同根管间呈水平、弧形或网状的通道，多见于根中1/3。

2、副根管：自髓室底至根分叉的通道，通向牙周膜的孔称为副孔，磨牙多见。

3、根管侧支：发自根管、与根侧(而非根尖)牙周膜相通的通道。

4、根尖分歧：根管在根尖分出的细小分支，与根尖分不同的是，此时根管仍然存在，即有一主根管。

5、根尖分叉：根管在根尖形成的2个以上的细小分支。与根尖分歧不同的是，此时主根管不再存在。

6、牙本质小管：接近根管的牙本质小管，直径多＞1μm。

参考资料：[1]樊明文.牙体牙髓病学.第4版[M].北京.人民卫生出版社.2013.