新生儿坏死性小肠结肠炎的病因十分复杂，尚未完全明确，目前一般认为是多因素共同作用所致，如早产、肠黏膜缺氧缺血、感染及肠道菌群异常等。

1、早产：胃肠道功能不成熟，胃酸分泌少，胃肠道动力差，食物易滞留而发酵，消化酶活力低，消化道黏膜通透性高，消化吸收功能差，局部免疫反应低下，肠道内分泌型lgA水平低，有利于细菌在肠腔内过度繁殖及迁移。当喂养不当感染或肠壁缺氧缺血时更易导致肠黏膜损伤。

2、肠黏膜缺氧缺血：缺氧缺血时机体重新分配全身血液以保证心脑等重要脏器的供应，此时肠系膜血管收缩使肠道血流减少至正常的35%-50%，从而发生缺氧缺血性损伤，缺血后再灌注可造成自由基大量产生，进一步损伤肠黏膜。围生期窒息严重呼吸暂停、严重心肺疾病、休克、交换输血、严重贫血、红细胞增多症、母亲孕期滥用可卡因等都可能通过肠壁缺氧缺血导致肠黏膜损伤。

3、感染及肠道菌群异常：母乳喂养的健康足月新生儿肠道菌群以双歧杆菌等益生菌为主，而早产儿或患病新生儿由于开奶延迟、长时间暴露于广谱抗生素等原因导致肠道内致病菌过度繁殖。此外，败血症、肠炎或其他严重感染时，病原微生物及其产生的毒素可直接损伤肠黏膜，或通过激活免疫细胞产生多种细胞因子而引起肠黏膜损伤，而早产儿在炎症因子作用下更易产生炎症反应。常见的致病菌有大肠埃希菌、状芽胞杆菌铜绿假单胞菌沙门菌肺炎克雷伯杆菌、产气荚膜杆菌、链球菌、凝固酶阴性葡萄球菌乳酸杆菌肠球菌等。病毒(如轮状病毒)和真菌也可引起本病。

参考资料：[1]桂永浩，薛辛东.儿科学.第3版[M].北京.人民卫生出版社.2015.